Introdução: A família Phenuiviridae se caracteriza por vírus que apresentam genoma de RNA linear de sentido negativo dividido em três segmentos (M, L e S). São transmitidos por artrópodes, apresentando como hospedeiros ruminantes, camelos e humanos. Objetivo: Identificar a presença de vírus em pools de cerca de 1.000 mosquitos coletados em 4 municípios do estado do Tocantins e compara-los aos genomas virais disponíveis no banco de dado GenBank. Material e Métodos: As amostras foram coletadas nos municípios de Aliança do Tocantins, Duére, Formoso do Araguaia e Gurupi. Após a coleta, as amostras foram solubilizadas em água e submetidas a ultracentrifugação para concentração das partículas virais. Em seguida, o DNA e o RNA viral foram extraídos e submetidos ao sequenciamento de nova geração na plataforma Illumina. As sequências curtas (reads) foram montadas em sequencias maiores (contigs) e submetidas à ferramenta BLASTx para detecção viral. Em seguida, os contigs pertencentes à mesma família foram estendidos com o software "PRICE".  Resultados: As sequências com alta similaridade aos vírus da família Phenuiviridae foram alinhadas pela ferramenta Mafft do software Geneious para posterior análise filogenética. Fragmentos parciais dos três segmentos gênicos (segmento L codificador da RNA polimerase viral, o segmento M e o segmento S) foram detectados nas amostras com, respectivamente, 97%, 96% e 96% de identidade nucleotídica com o vírus Phasi Charoen-like.  Conclusão: O sequenciamento de nova geração aplicado em amostras de mosquitos se apresenta como uma ferramenta viável para a detecção e o monitoramento de novos arbovírus que potencialmente podem infectar humanos e outros animais.

Palavras chave: Phenuiviridae, Arbovírus, vírus Phasi Charoen-like, Viroma.